gff3ToGenePred的下载及使用

gff3ToGenePred的下载及使用

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gff3ToGenePred

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blast的安装及使用

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brew的安装参见Homebrew的安装及使用

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brew install blast

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aspera的安装及使用

ascper可以解决在ncbi数据库中上传及下载大批量数据的问题,下载及上传速度通常可以达到10m以上。

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python中的lambda,reduce,filter,map

  • lambda 匿名函数,不能使用关键词如if
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#求和计算
In [13]: a = lambda x,y: x+y

In [14]: a(2,3)
Out[14]: 5

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python中append、insert、extend的区别

append、insert、extend都是python中列表用来添加元素的方法,但又有所区别。


  • append 默认添加一个对象到列表最后

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Homebrew的安装及使用

Homdebrew的功能类似于Centos下的yum以及Ubtuan下的apt-get,最方便的就是可以将Linux下的一些命令移植到Mac上,从而免去编译安装带来的很多依赖包及报错。

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fugu,骑着河豚愉快的传输文件

转战Mac许久,系统自带的终端的确是6的飞起,无奈每逢和服务器交互的时候真心觉得scp不习惯,今天偶然发现了fugu,大家可以自己尝试一下,终于不用再怀念windows下的SSH Secure Shell Client了。

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fastSTRUCTURE的安装及使用

fastSTRUCTURE是一款使用python编写的程序,可以计算群体结构,十分方便。


依赖工具

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    如何使用ggplot2修改颜色

    通常ggplot2默认的颜色已经比较好看了,但是为了更加自由,还是有必要学会自己如何调色。ggplot中控制颜色的函数为scale_colour_xxx或者scale_fill_xxx的形式,其实是大同小异,下面以scale_color_xxx为例进行讲解。


    离散型变量

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      R语言绘制频率直方图

      频率直方图是数据统计中经常会用到的图形展示方式,R基础做图中的hist函数对单一数据的展示很方便,但是当遇到多组数据的时候就不如ggplot2绘制来的方便。


      使用基础做图

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      hist(rnorm(200),col='blue',border='yellow',main='',xlab='')

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