生物信息数据库

  • abc 最初上罗静初老师的生物信息学课所学到的第一个数据库网站,收录了非常多的数据库网站链接,weblab的功能也不错,适合小数据量的分析
  • NCBI 美国国立生物技术信息中心,经常使用pubmed用来检索文献,在线blast的功能也不错,就是比较依赖网速,建议序列多的时候使用本地blast
  • EBI 欧洲生物信息研究所,数据库内容与NCBI同步,下载SRA的数据比NCBI方便;通常都是NCBI来大姨妈的时候才会使用
  • DDBJ 日本DNA数据库,数据库内容与NCBI及EBI同步,因为是小日本的,所以很少使用
  • TAIR 拟南芥数据库,做植物的都会用得到,可以用来购买拟南芥突变体

工具类网站

  • 韦恩图
  • GDSD 北大的一个网站,当年绘制基因结构经常使用这个网站,可以批量且支持多种格式